viernes, 1 de febrero de 2013

Cuando la genética conoció a la bioquímica y una pregunta trampa les unió.

Esta semana me tocaba clase de Genética Humana (cómo he acabado dando el tema de mapas genéticos en una asignatura de un máster de Biomedicina es una larga historia). Cuando doy clase me gusta hacerles preguntas aparentemente inocentes, pero que tienen muy mala idea. Por una parte trato de aligerar un poco el rollo que les estoy soltando y por otra ver si realmente saben lo que deben saber. En este caso la pregunta inocente fue"¿Supongo que sabéis quién descubrió el ADN?" y todos al unísono.... Watson y Crick. Y yo ¿seguro?, bueno y Rosalind Franklin dijeron algunos. Si les hubiera preguntado quién dirigió "El Tercer Hombre" me hubieran dicho que Orson Welles, pero no, no es el caso. Para que Watson y Crick interpretaran los datos de Rosalind Franklin hubo que andar un largo camino. Y ESTO UN ESTUDIANTE DE MASTER DEBERÍA SABERLO.

¿Quién descubrió el ADN?
El ADN lo descubrió el médico Suizo Friedrich Miescher, trabajando en Tübingen en el laboratorio de Felix Hoppe-Seyler a partir de los restos de pus de las vendas de los soldados heridos en la guerra Franco-Prusiana. El pus es básicamente restos de glóbulos blancos y células muertas y el ADN es muy estable, por lo que al no degradarse se acumula, lo que contribuye a darle la típica consistencia viscosa. Una preparación en laboratorio de ADN genómico de cualquier organismo también tiene esa consistencia viscosa. Miescher también descubrió que se acumula en el núcleo de las células, por lo que le llamó originalmente "nucleína". Años después trabajando en su Basilea natal, descubrió que el esperma de salmón era rico en esta sustancia de carácter ácido, y que además va asociada con otras moléculas, muy básicas, a las que denominó protaminas. Lo que había descubierto eran las histonas, proteínas alrededor de las cuales se enrolla el ADN. Actualmente el esperma de salmón se sigue utilizando como ADN inespecífico o ADN carrier en muchas técnicas de biología molecular (hay protocolos en los que necesitas ADN, pero te da igual la secuencia que tenga). Un efecto secundario de esta viscosidad del ADN lo sufren los pacientes de fibrosis quística. Debido a la mutación en un canal de iones no pueden regular la mucosidad ni el sudor (que es más salado que de normal). En las vías respiratorias esto favorece coger infecciones. El principal problema que tienen es la viscosidad de las células muertas que impide respirar. Un tratamiento sintomático es un spray con DNAasa, molécula que degrada el ADN.


File:Friedrich Miescher.jpg
Miescher, descubridor del ADN
¿Miescher supo la transcendencia de su descubrimiento?
Pues realmente no. En su momento está molécula no tenía una función clara. Se suponía que podría tener una función estructural dentro del núcleo. Hasta aquí fue un descubrimiento, aparentemente poco relevante y en el campo de la química, o de la muy incipiente bioquímica. La genética se estaba desarrollando, por caminos aparentemente separados. Ni Darwin ni Mendel tuvieron una base molecular para sus descubrimientos sobre herencia o evolución y formularon sus teorías sobre caracteres externos, sin tener ni idea de qué molécula era responsable de transmitir esa herencia ni de qué factores pueden hacer que cambie. Mendel en su momento fue un poco tramposillo, pero de eso hablaremos otro día. Darwin sí que tiene una relación con la biología molecular, pero muy peculiar. En 1882 Walter Drawbridge Crick, abuelo de Francis Crick, fabricante de zapatos y malacólogo (estudioso de las conchas) aficionado escribió a Charles Darwin para describirle su hallazgo de una minúscula concha de agua dulce en la pata de un escarabajo de agua. El 6 de abril de 1882 (13 días antes de la muerte de Darwin) salió publicado un artículo en Nature en el que describía el bivalvo que le había enviado el abuelo de Francis Crick. Por lo tanto sí que hay alguna relación de Darwin con la biología molecular, pero lejana. La saga familiar no acaba con Francis. Su hijo hizo una aportación clave a la cultura popular.  Michael Crick fue diseñador de video juegos en la época de las consolas Atari y de los primeros salones recreativos con videoconsolas, entre ellos, el famoso de la rana que cruzaba carreteras. 

¿Tuvieron alguna relación Miescher, Darwin y Mendel?
Poca, a pesar que los tres fueron prácticamente coetáneos, solo Mendel tuvo constancia del trabajo de Darwin (gracias por el apunte Manuel), pero no a la inversa y Ni Darwin ni Mendel supieron de la molécula que descubrió Miescher y por supuesto ni llegaron a imaginarse lo relacionados que estaban. Aunque Darwin estuvo muy cerca de intuir o descubrir las leyes de Mendel, gracias a unas observaciones en guisantes. No obstante el miraba los caracteres y los aspectos morfológicos en general, no tuvo el acierto de Mendel (y alguna trampita, insisto) de observarlos como caracteres independientes. Hoy en día sería impensable este desconocimiento mutuo. Por suerte tenemos tecnologías de la información y un idioma universal en ciencia (el inglés) que permite un flujo de información casi instantáneo, lo que permite optimizar los esfuerzos y crear sinergias.


Rosalind Franklin, fallecida antes del Nobel.

¿Quién descubrió que el ADN lleva la información genética?
Pues fueron Oswald Avery, Colin MacLeod, and Maclyn McCarty trabajando en el instituto Rockefeller. Unos años antes Griffith había descubierto que existía un principio transformante capaz de transformar cepas virulentas de pneumococo en cepas no virulentas. Su experimento consistió en demostrar que cepas no virulentas se transformaban en virulentas al estar en contacto con células virulentas muertas. El experimento de Avery, MacLeod y McCarty demostró que la molécula responsable de transmitir esa información era el ADN. Hasta ese momento se pensaba que era un proteína, ya que tenía vigencia la hipótesis de Levene según la cual las cuatro bases que forman el ADN (Adenina, Guanina, Citosina y Timina) se agrupaban formando tetranucleótidos y tenían una función estructural. También pesaba el error del premio Nobel Willstätter, que había afirmado que podía catalizar reacciones químicas con extractos libres de proteínas. Luego se vio que era debido a un error experimental. Hasta muchos años después Thomas Cech no descubrió el ARN con capacidad catalítica.  Hasta la demostración de Avery, MacLeod y McCarty de que el ADN era la molécula que explicaba el experimento de Griffith, las proteínas estaban consideradas como los candidatos idóneos para ser portadoras de la información genética.


Oswald Avery

¿Entonces, qué descubrieron Watson y Crick?
Watson y Crick descifraron la estructura del ADN, proponiendo el modelo, confirmado experimentalmente, de la doble hélice antiparalela, en la cual las adeninas emparejan con las timinas y las guaninas con las citosinas, adelantándose a otros grupos que estaban tratando de descifrarla como el de Linus Pauling (que había propuesto una estructura en triple hélice). Para descifrar la estructura utilizaron datos de Rosalind Franklin. Circula la historia que fue una injusticia que Franklin no recibiera el premio Nobel, pero la realidad es que Rosalind falleció en 1958 y Watson y Crick, junto con Maurice Wilkins, colega de Rosalind Franklin, recibieron el premio Nobel en 1962. Las bases del premio explicitan que no se concede a título póstumo, solo en el caso que el agraciado fallezca entre el momento del fallo del jurado y la entrega del premio, como sucedió con Ralph Steinmann en el 2011. En su momento el modelo propuesto tenía un error puesto que suponía que la guanina y la citosina se enlazaban mediante dos puentes de hidrógeno, cuando en realidad son tres. Watson y Crick tampoco descubrieron que el ADN se replica de forma semiconservativa, ya que eso fue mérito de Messelson y Stahl unos años después utilizando isótopos pesados de nitrógeno. Por lo demás últimamente James Watson es noticia por hacer declaraciones muy raras sobre el cáncer, o algunas sobre razas humanas. En el año 2006, mientras estaba de realizando mi postdoctoral en Basilea tuve ocasión de asistir a una charla que impartió en mi centro. La verdad, el pobre señor se notaba que no estaba para historias. Digamos que su privilegiado cerebro sufre los estragos de la edad como cualquier otro. De hecho alguien le preguntó por Rosalind Franklin y se salió por peteneras. Yo no le daría demasiada importancia a lo que dijera en lo que le quede de vida, por muy James Watson que sea.


File:Griffith experiment.svg
Experimento de Griffith (via wikipedia)

Más preguntas trampa en genética:
Ya puestos aviso de otras preguntas trampa que puedo poner en genética humana. Por ejemplo ¿cuantas copias del genoma hay en una célula? a esto contestan que dos, pero olvidan el detalle del genoma mitocondrial, que está presente en varias copias (hasta 10) dentro de las mitocondrias, por lo tanto en una célula hay dos copias del genoma nuclear y un número variable y muy alto de copias del genoma mitocondrial. Es variable porque a) no todas las mitocondrias tienen el mismo número de copias del genoma, b) no todas las células tienen el mismo número de mitocondrias. Otra pregunta trampa ¿Cuantos genomas hay en un ser humano? La contestación obvia es dos, el humano y el mitocondrial, pero se olvidan de todo el microbioma simbiótico o parásito que vive en nuestro interior, más los virus que todos portamos y que en general no causan patología. Lo dicho, hay que pensarse la respuesta antes de soltarla a lo loco.

PD: Después de esto nadie les libró de un rollo sobre mapas de ligamiento y distancias genéticas. 

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Y con esto participo en la XXI edición del carnaval de química que organiza el blog "pero eso es otra historia que debe ser contada en otra ocasión" de @Ununcuadio.

Y en la XX del carnaval de biología que organiza @multivac en Forestalia.


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lunes, 28 de enero de 2013

Debate sobre el auge de las medicinas naturales, acupuntura y homeopatía.

Gabriel Andrade, autor de "La Inmortalidad ¡vaya timo!" lleva el programa de radio Ágora, en Luz Radio de la Universidad de Zulia, en Maracaibo (Venezuela). Parece que en el pais caribeño hay una corriente, bastante importante, de rechazo a la medicina convencional y de vuelta al chamanismo o a la pseudomedicina tradicional por motivos ideológicos. Dentro de esta corriente de supeditar la ciencia a la ideología y justificar que por que una cosa se hace desde hace mucho tiempo es mejor.... Debatimos sobre este tema y sobre terapias alternativas como la homeopatía o la acupuntura en su programa de radio.

Parte I:


Parte II:



Parte III:




Parte IV:




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lunes, 21 de enero de 2013

La difícil relación entre las dos culturas

Acabo de leer, con gran placer, el último libro de Francisco García Olmedo titulado "En el Espejo de los Días". García-Olmedo es catedrático, jubilado, de la Universidad Politécnica de Madrid y uno de los referentes de la investigación en biotecnología en España. Fue uno de los primeros ¿o el primero? en realizar transformaciones de plantas y por ende en crear las primeras líneas de plantas transgénicas "made in Spain". Además es un brillante divulgador autor de libros como "La tercera revolución verde" o "el Ingenio del hambre", que son unas auténticas joyas. Este último libro viene a ser una especie de falso diario que transcurre entre el 28 de noviembre del 2011 y el 11 de julio del 2012 donde los hechos de cada día sirven de enlace o de excusa para ir deshilachando diferentes recuerdos o historias de su vida, a modo de autobiografía. Por lo tanto es un libro de un científico, pero no se habla de ciencia, o no mucho, ya que esta tiene un papel secundario o solo sirve de excusa. Hay muchos episodios relacionados con al vida de algunos de los muchos científicos que ha conocido, pero también se comentan episodios de la la vida social española y europea de las últimas décadas. Se me ha olvidado mencionar un pequeño detalle. García Olmedo es científico, pero también es autor de libros de poesía, de novelas y en su juventud hizo sus pinitos como guitarrista. El García de García Olmedo además lo emparenta con lo mejor de la literatura, puesto que es primo segundo de Federico García Lorca, de cuyos veranos con sus hermanas y sus estancias en la casa de Madrid da cumplida cuenta en el libro. García Olmedo además ha tenido, por circunstancias familiares o profesionales, la oportunidad de codearse con lo más granado de la intelectualidad y al política española. Así en el libro se pueden leer sus anécdotas con el pintor abstracto Fernando Zóbel, o con su familiar el pintor Guerrero, con Esperanza Aguirre, sus debates con dirigentes de Greenpeace o como en los años 50 estuvo a escasos 50 cm de cambiar la historia de España en una caseta de la feria de Sevilla. No estamos ante un libro de ciencias sino un libro de letras donde se habla de literatura, de arte y de política en primera persona, escrito por un científico, que a la vez es un gran humanista y hombre de letras. 



Mientras lo leía (en dos sentadas) no podía evitar pensar sobre el ficticio o artificioso mundo de las dos culturas, ese que dice que la gente es de ciencias o de letras. Que alguien sea digamos "de ciencias" no implica que no pueda dedicarse a la literatura con notable éxito, quizás la relación no sea biunívoca y es más raro encontrar a gente de letras que se dedique a la ciencia, aunque algunos libros brillantes de divulgación científica han sido escritos por gente que no tenía formación científica. Tampoco ayuda que entre cierto sector de la presunta "intelectualidad" o pseudointelectualidad española haya un cierto desdén o prejuicio hacia las ciencias, quizá como reacción por no admitir su propia ignorancia. 


Fuente: http://josepgmaynou.blogspot.es/

Si alguna vez escribo en un post que el Quijote lo escribió Lope de Vega, me dirían de burro para arriba y con razón. Por suerte, a pesar de ser "de ciencias" sé que lo escribió Cervantes, incluso siendo pejigotero podría decir que debido al éxito de la primera parte aparecieron varios Quijotes apócrifos, siendo el más conocido el Quijote de Avellaneda y esto fue una de las causas que llevó a Cervantes a escribir la segunda parte. En cambio en muchos artículos, columnas de opinión o declaraciones de gente "de letras" suelen meter la pata espectacularmente, confundir conceptos y dejar en evidencia su escaso rigor por lo menos para documentarse.Entre los ejemplos más destacados tendríamos a Juan Manuel de Prada cuestionando la evolución, a Cesar Vidal considerando la grafología como una ciencia o a Joan Rossell demostrando que no tiene ni idea de genética



El problema es que el desdén por la "cultura científica" parece ser algo más que alguna metida de pata sino que está bastante enquistado en nuestra cultura. por ejemplo, solo basta buscar términos científicos en el diccionario de la RAE para encontrarnos una falta de criterio y a veces de rigor en al definición de términos relacionados con la biología o la física (sobre este tema recomiendo este podcast de "El rincón prohibido").



Otra curiosidad de este conflicto entre las dos culturas y como se es más estricto con los de ciencias cuando hablan de letras, pero nunca a la inversa es cuando hacemos textos técnicos en castellano, como puede ser una tesis o un proyecto fin de carrera. La norma es traducir los términos científicos en inglés a su equivalente en castellano. eso tiene el problema que muchas veces no hay una traducción oficial. Por ejemplo, una búsqueda en una colección de genes (en inglés "screening") lo he visto traducido como escrutinio, cribado o rastreo. Incluso alguien ha tirado de traductor automático y se le ha escapado decir apantallamiento. Con la diferencia que un screening todo el mundo sabe o que es, y cuando utilizas el término en castellano no precisas a que te estás refiriendo, pero claro, utilizar el término inglés es un barbarismo y se penaliza en cualquier evaluación. Lo normal, para facilitar la lectura, es que la primera vez que se utiliza el término se pone entre paréntesis el nombre en inglés para especificar a que te refieres y evitar equívocos, algo que el lenguaje científico no puede permitirse. Sin embargo cuando vas a cualquier texto jurídico o en mucho textos históricos, aparecen muchísimas expresiones latinas y no se consideran barbarismos, sino cultismos y no tienen la categoría de error o de perversión del lenguaje. 


Volviendo al libro hay otra cosa que me ha hecho ser pesimista sobre la cultura científica en España. El libro está autoeditado. En una conferencia reciente en el IBMCP García Olmedo comentó la dificultad de encontrar editor para su obra más reciente. Hoy en día cuando entras en cualquier librería te das cuenta que se vende básicamente autoayuda, libros de cocina o dietas, libros de gente que sale por la tele y best sellers facilones. Una lástima que obras tan interesantes como  estas no puedan abrirse al público en general y queden como bocados de gourmet para que las disfrutemos unos pocos. 

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Y esta es mi aportación al III carnaval de humanidades que con el el lema "con C de ciencia y Cultura" se aloja en el blog "El cuaderno de Calpurnia Tate".
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domingo, 20 de enero de 2013

Bienvenidos al Hotel Boutique Zombie, gentileza de Amazon.es

La verdad es que desde que abrí este blog me han llamado muchas cosas raras, pero quien me iba a decir que lo más raro me lo diría Amazon. Hace unos meses me apunté al programa de afiliados de Amazon por curiosidad de ver como funcionaba poner publicidad en el blog. En menos de tres meses conseguí la espectacular cifra de 3,76 euros, que tampoco es que me fuera a solucionar la vida, pero siempre hace ilusión tomarte una caña (sin tapa) y que te la subvencione Amazon. La sorpresa fue ayer cuando voy a ver la cuenta y me encuentro con este mensaje amenazador.


La cosa es flipante porque no he recibido ninguna comunicación oficial de Amazon por este hecho, y lo más divertido, los enlaces siguen funcionando perfectamente. Cualquiera puede comprar productos de Amazon desde mi página. Vaya morro, yo sigo haciendo publicidad pero ellos no me facturan los ingresos. Dado que desde que me hice del programa de afiliados recibo un montón de mails de Amazon informándome de las últimas novedades y de todo lo que me puedo comprar, que menos que notificarme la decisión unilateral de cancelar la cuenta. Confirmo que todavía puedo generar enlaces, por si quiero ponerlos en mi página. 

Consulto el foro de afiliados y parece que hay alguien más en mi situación, pero por si acaso, envío un correo a la dirección de contacto pidiendo explicaciones sobre el cierre de mi cuenta. El surrealista mail que recibo es este:

Esta es la transcripción:

Estimado JM:
Lamento mucho el inconveniente, he revisado tu cuenta y te informo de que de acuerdo a nuestro Acuerdo Operativo, ciertos sitios web no son apropiados para formar parte del Programa de Afiliados.
De acuerdo con esta información, siento informarte de que tu solicitud ha sido rechazada ya que tu sitio web se trata de un hotel boutique Zombie y de acuerdo con la información de la cuenta debe ser rechazada.
Puedes consultar nuestro Acuerdo Operativo íntegramente en el enlace siguiente (en inglés):
https://afiliados.amazon.es/gp/associates/help/operating
Asimismo, te informo de que puedes volver a solicitar unirte al Programa de Afiliados de Amazon.es si tu sitio web respeta las condiciones establecidas en nuestro Acuerdo Operativo.
Te agradezco tu interés en el Programa de Afiliados de Amazon.es
Atentamente
Leon E
Servicio de Atención al Cliente Amazon.es
http://www.amazon.es
O sea que su algoritmo ha decidido que no tengo un blog de divulgación científica sino una "hotel Boutique Zombi", pero ¿eso que es? ¿el último complemento de las Monster High? Pues nada, tan amigos, el gerente de Hotel Transilvania se despide. He quitado todos los banners de Amazon y no me pienso comprar un Kindle. Ahora el siguiente paso es conseguir que dejen de enviarme correo mercadillo vampiro, lease spam y si fuera posible, cobrar los 3,76 euros que he facturado.

Puedes darle visibilidad a esta entrada votando aquí. Gracias. 



Por lo visto después del Hotel California, de Eagles, viene el Hotel Boutique Zombie de Amazon.

Actualización 29-1-2013:

Envío esta queja a la dirección de contacto:


Comments:
  No creo que cerrar una cuenta sin previo aviso y sin derecho a réplica sea una política muy útil, pero si encima la comunicación se hace utilizando un traductor automático ya es de risa.
Seguido de un enlace a este post.


Y al poco recibo una llamada de teléfono del servicio de atención al cliente de Amazon, pidiéndome disculpas y achacando el problema a un error del sistema. Les pregunto si el correo era automático o realmente alguien ha escrito lo del "Hotel Boutique Zombie", parece ser que realmente alguien lo ha escrito. Le pregunto si me puede explicar lo que es, pero vuelve a pedirme disculpas. Me ofrecen seguir en el programa o cancelarlo y abonarme lo (poquísimo) que he acumulado... y puesto que se han disculpado, lo acepto. Me envían la disculpa por mail.



La transcripción es esta:

Estimado Miguel,
En respuesta a su consulta acerca del cierre de su cuenta de Afiliados , le pido que por favor acepte mis disculpas por las molestias ocasionadas ya que puedo verificar que no se le notifico al respecto.
Como hablamos por teléfono, le confirmo que su tienda ha sido abierta y las comisiones al día de hoy por XX pedidos realizados a través de sus enlaces son por un importe XX están activas. Le recuerdo que las comisiones por publicidad a través de deposito directo se harán cuando el importe que le sea debido alcance los XX euros.
Gracias por habernos dado otra oportunidad para demostrarle la calidad de nuestro servicio de Afiliados.
Atentamente
Raquel G
Servicio de Atención al Cliente Amazon.es http://www.amazon.es

Es la primera vez que he tenido la sensación que este blog es útil.


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jueves, 17 de enero de 2013

Debate en A2-societat sobre agricultura ecológica.

Ayer estuve en el prrgrama A2-Societat debatiendo sobre agricultura ecológica con José Martí de la finca la Peria en Benifayó, ya os aviso que es mi versión más Teletubby. Ayer estaba tranquilo y José tampoco dijo nada muy gordo. El debate es en valenciano. 

Se puede ver en el siguiente enlace.
A2- Societat - Cap. 120



Y aprovecho al ocasión para deciros que el próximo 23 de Enero estaré en la jornada que organiza El Ser Creativo en Madrid Fusión hablando de transgénicos. La ponencia se titula: mamá, me he comido un transgénico.






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lunes, 14 de enero de 2013

Decálogo del divulgador científico

Comparto el vídeo que ha hecho la Asociación Española de Comunicación Científica en homenaje a Manuel Calvo Hernando. No puedo estar más de acuerdo en todos sus puntos. Creo que los que nos dedicamos a divulgar ciencia, ya sea profesionalmente, o como un servidor, por afición y amor al arte deberíamos tenerlo siempre presente.





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viernes, 11 de enero de 2013

Sobre la amable naturaleza

Para el viernes tarde un micro post de humor. Un video que no deja de ser una interesante lección sobre lo que es la naturaleza.

. El video tiene toda la pinta de fake, pero no por eso deja de ser divertido. Me he acordado de todos los que piensan que el adjetivo "natural" implica que es mejor o más sano. Por cierto, liberar mascotas o animales domésticos no te convierte en concienciado, sino en irresponsable. Lo más normal es que la mascota se muera, pero si no lo hace puede crear algún problema, como pasa con las tortugas de Florida en España. uno de los casos más graves se dío a raíz de la película "buscando a Nemo". Los chavales empezaron a tirar los peces del acuario por los desagues, en aguas frías los peces se morían y punto, el problema fue en Florida, donde muchos peces exóticos tropicales se adaptaron y han creado auténticos problemas ecológicos en el caribe, el principal debido al pez escorpión.
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